Een aantal boeken dat niet voorkomt in de Hebreeuwse Bijbel maar wel in de Septuaginta, staat binnen de katholieke traditie bekend als deuterocanoniek. Het betreft de boeken, Judit, Tobit, Sirach, Wijsheid, Baruch (inclusief de Brief van Jeremia), 1 en 2 Makkabeeën, alsmede uitgebreide versies van de boeken Ester en Daniël. De term deuterocanoniek komt van het Griekse woord deuteros ‘tweede’, gecombineerd met het woord canon (zie de rubriek Canon). Men moet ‘deutero’ niet opvatten als ‘tweederangs’, maar als ‘in tweede instantie’. Terwijl de boeken van de Hebreeuwse Bijbel in eerste instantie canoniek waren, was een reeks boeken uit de Septuaginta in tweede instantie canoniek. Binnen de protestants-christelijke traditie echter gelden deze boeken als apocriefe boeken.